什么叫非冗余基因集

转录小白日志丨关于数据库的儿

1、NR（Non-Redundant Protein Sequence Databa）数据库，收录了GenBank、EMBL、DDBJ和PDB中的所有非冗余蛋白序列。NR库提供核酸与蛋白数据间的交叉索引，便于用户查找。NT（Nucleotide Sequence Databa）是核酸序列数据库，二者均能在NCBI上通过BLAST或从ftp：//。

2、NR数据库是所有GenBank+EMBL+DDBJ+PDB中的非冗余蛋白序列，提供氨基酸序列及专门蛋白数据库序列号。NT数据库则包含核酸序列数据。两者均能通过NCBI进行BLAST比对，或至本地。GO数据库 GO数据库旨在建立跨物种的基因和蛋白质功能描述语言标准。它包含分子功能、细胞组分、生物过程三个层次的定义。

3、这一过程中，蛋白质会发生各种类型的翻译后修饰（PTMs），在UniProt数据库中记录了400多种修饰类型，其中真核生物有326种，细菌有250种，古生菌有80种。PTM在几乎所有细胞过程中都扮演着关键角色，如细胞周期、降解、凋亡、信号传导、转录等。