如何qsub提交作业到集群

在Linux系统中，`qsub` 是一个用于提交作业到高性能计算（HPC）集群的命令行工具。以下是一般步骤，用于使用 `qsub` 提交作业：

1. 编写作业脚本：

你需要创建一个shell脚本文件，通常以 `.sh` 为扩展名。在这个脚本中，你需要指定你的作业所需的资源，如CPU时间、内存大小、节点数量等。

例如，以下是一个简单的作业脚本 `my_job.sh`：

```bash

!/bin/bash

PBS -N my_job

PBS -l nodes=1:ppn=1

PBS -l walltime=00:10:00

PBS -o my_job.out

PBS -e my_job.err

echo "Starting job at $(date)"

echo "Running on $(hostname)"

sleep 10

echo "Job finished at $(date)"

```

这段脚本做了以下几件事情：

使用 `PBS` 语句定义作业的属性。

`-N` 指定作业名称。

`-l nodes=1:ppn=1` 指定使用1个节点，每个节点1个处理器（ppn）。

`-l walltime=00:10:00` 指定作业的最大运行时间为10分钟。

`-o my_job.out` 指定标准输出文件。

`-e my_job.err` 指定标准错误文件。

2. 提交作业：

在命令行中，使用 `qsub` 命令提交你的作业脚本。

```bash

qsub my_job.sh

```

`qsub` 会返回一个作业ID，例如 `12345`。

3. 监控作业状态：

使用 `qstat` 命令可以查看作业的状态。

```bash

qstat -u your_username

```

其中 `-u your_username` 指定用户名，以查看该用户的所有作业。

4. 获取作业结果：

当作业完成后，你可以通过作业ID来获取输出文件。

```bash

cat my_job.out

```

或者，你可以直接查看 `my_job.out` 文件，它包含了作业的输出。

请注意，具体的 `qsub` 语法和参数可能因不同的HPC集群而异，所以最好查看你所在集群的文档来获取正确的命令行选项。